Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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GRIK4Q16099 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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GRIK4Q16099 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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GRIK4Q16099 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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GRIK4Q16099 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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GRIK4Q16099 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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GRIK4Q16099 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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GRIK4Q16099 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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GRIK4Q16099 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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GRIK4Q16099 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GRIK4Q16099 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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