Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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