Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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SYCP1Q15431 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SYCP1Q15431 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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