Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
POLD3Q15054 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
POLD3Q15054 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms