Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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TRIM25Q14258 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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TRIM25Q14258 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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TRIM25Q14258 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TRIM25Q14258 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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