Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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