Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF5Q13243 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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