Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TROQ12816 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TROQ12816 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TROQ12816 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TROQ12816 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TROQ12816 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TROQ12816 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TROQ12816 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TROQ12816 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TROQ12816 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TROQ12816 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TROQ12816 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TROQ12816 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TROQ12816 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TROQ12816 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TROQ12816 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TROQ12816 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TROQ12816 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TROQ12816 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TROQ12816 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TROQ12816 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TROQ12816 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TROQ12816 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TROQ12816 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TROQ12816 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TROQ12816 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TROQ12816 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TROQ12816 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TROQ12816 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TROQ12816 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TROQ12816 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TROQ12816 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TROQ12816 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TROQ12816 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TROQ12816 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TROQ12816 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TROQ12816 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TROQ12816 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TROQ12816 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TROQ12816 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TROQ12816 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TROQ12816 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TROQ12816 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TROQ12816 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TROQ12816 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TROQ12816 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TROQ12816 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TROQ12816 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TROQ12816 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TROQ12816 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TROQ12816 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TROQ12816 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TROQ12816 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TROQ12816 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TROQ12816 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TROQ12816 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TROQ12816 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TROQ12816 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TROQ12816 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TROQ12816 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TROQ12816 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TROQ12816 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TROQ12816 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TROQ12816 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TROQ12816 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TROQ12816 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TROQ12816 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TROQ12816 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TROQ12816 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TROQ12816 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TROQ12816 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TROQ12816 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TROQ12816 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TROQ12816 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TROQ12816 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TROQ12816 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TROQ12816 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TROQ12816 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TROQ12816 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TROQ12816 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TROQ12816 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TROQ12816 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TROQ12816 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TROQ12816 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TROQ12816 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TROQ12816 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TROQ12816 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TROQ12816 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TROQ12816 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TROQ12816 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TROQ12816 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TROQ12816 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TROQ12816 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TROQ12816 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TROQ12816 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TROQ12816 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TROQ12816 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TROQ12816 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TROQ12816 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TROQ12816 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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