Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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