Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms