Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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IFFO1Q0D2I5 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 ARPIN-201ENST00000357484 7591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IFFO1Q0D2I5 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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