Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOLGA3Q08378 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms