Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms