Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF4Q08170 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms