Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CRIP1P50238 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms