Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PIP4K2AP48426 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms