Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPB2P35606 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPB2P35606 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPB2P35606 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPB2P35606 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPB2P35606 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPB2P35606 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPB2P35606 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPB2P35606 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPB2P35606 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPB2P35606 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
COPB2P35606 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPB2P35606 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
COPB2P35606 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
COPB2P35606 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
COPB2P35606 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPB2P35606 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
COPB2P35606 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPB2P35606 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPB2P35606 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPB2P35606 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
COPB2P35606 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPB2P35606 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPB2P35606 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
COPB2P35606 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPB2P35606 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPB2P35606 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPB2P35606 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPB2P35606 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPB2P35606 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPB2P35606 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPB2P35606 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPB2P35606 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPB2P35606 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPB2P35606 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPB2P35606 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPB2P35606 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPB2P35606 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPB2P35606 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPB2P35606 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPB2P35606 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPB2P35606 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPB2P35606 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPB2P35606 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPB2P35606 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPB2P35606 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPB2P35606 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPB2P35606 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPB2P35606 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPB2P35606 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPB2P35606 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPB2P35606 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPB2P35606 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPB2P35606 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPB2P35606 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
COPB2P35606 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPB2P35606 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPB2P35606 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPB2P35606 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPB2P35606 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPB2P35606 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
COPB2P35606 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPB2P35606 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
COPB2P35606 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPB2P35606 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPB2P35606 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPB2P35606 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPB2P35606 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPB2P35606 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPB2P35606 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPB2P35606 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPB2P35606 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPB2P35606 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPB2P35606 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPB2P35606 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPB2P35606 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPB2P35606 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPB2P35606 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPB2P35606 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPB2P35606 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPB2P35606 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPB2P35606 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPB2P35606 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPB2P35606 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPB2P35606 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPB2P35606 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPB2P35606 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPB2P35606 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPB2P35606 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPB2P35606 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPB2P35606 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPB2P35606 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPB2P35606 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPB2P35606 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPB2P35606 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
COPB2P35606 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
COPB2P35606 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
COPB2P35606 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPB2P35606 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
COPB2P35606 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms