Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFNP31947 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFNP31947 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFNP31947 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFNP31947 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFNP31947 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFNP31947 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFNP31947 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFNP31947 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFNP31947 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFNP31947 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFNP31947 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFNP31947 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFNP31947 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFNP31947 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFNP31947 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFNP31947 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFNP31947 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFNP31947 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFNP31947 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFNP31947 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFNP31947 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFNP31947 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFNP31947 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFNP31947 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFNP31947 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFNP31947 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFNP31947 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SFNP31947 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFNP31947 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFNP31947 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFNP31947 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFNP31947 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFNP31947 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SFNP31947 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SFNP31947 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFNP31947 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFNP31947 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SFNP31947 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFNP31947 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFNP31947 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFNP31947 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFNP31947 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFNP31947 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFNP31947 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFNP31947 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFNP31947 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFNP31947 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFNP31947 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFNP31947 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFNP31947 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFNP31947 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFNP31947 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFNP31947 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFNP31947 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFNP31947 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFNP31947 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFNP31947 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFNP31947 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFNP31947 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SFNP31947 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFNP31947 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFNP31947 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFNP31947 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFNP31947 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFNP31947 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SFNP31947 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SFNP31947 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFNP31947 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFNP31947 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFNP31947 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFNP31947 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFNP31947 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFNP31947 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFNP31947 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFNP31947 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFNP31947 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFNP31947 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFNP31947 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFNP31947 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFNP31947 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFNP31947 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFNP31947 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFNP31947 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFNP31947 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFNP31947 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFNP31947 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFNP31947 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SFNP31947 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFNP31947 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFNP31947 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFNP31947 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFNP31947 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFNP31947 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFNP31947 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFNP31947 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFNP31947 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFNP31947 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFNP31947 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SFNP31947 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms