Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP1P29466 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP1P29466 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP1P29466 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP1P29466 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP1P29466 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP1P29466 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP1P29466 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP1P29466 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP1P29466 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP1P29466 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP1P29466 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP1P29466 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP1P29466 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP1P29466 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP1P29466 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP1P29466 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP1P29466 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP1P29466 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP1P29466 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP1P29466 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP1P29466 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP1P29466 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP1P29466 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP1P29466 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP1P29466 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP1P29466 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP1P29466 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP1P29466 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP1P29466 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP1P29466 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP1P29466 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP1P29466 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP1P29466 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP1P29466 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP1P29466 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP1P29466 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP1P29466 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP1P29466 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CASP1P29466 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP1P29466 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP1P29466 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP1P29466 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP1P29466 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP1P29466 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP1P29466 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP1P29466 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP1P29466 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP1P29466 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP1P29466 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP1P29466 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP1P29466 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP1P29466 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP1P29466 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP1P29466 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP1P29466 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP1P29466 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP1P29466 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP1P29466 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP1P29466 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP1P29466 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP1P29466 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP1P29466 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP1P29466 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP1P29466 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP1P29466 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP1P29466 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP1P29466 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP1P29466 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP1P29466 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP1P29466 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP1P29466 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP1P29466 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP1P29466 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP1P29466 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP1P29466 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP1P29466 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP1P29466 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP1P29466 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP1P29466 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP1P29466 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP1P29466 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP1P29466 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CASP1P29466 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP1P29466 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP1P29466 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP1P29466 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP1P29466 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP1P29466 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP1P29466 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP1P29466 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP1P29466 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP1P29466 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP1P29466 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP1P29466 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP1P29466 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP1P29466 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP1P29466 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP1P29466 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP1P29466 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms