Protein–RNA interactions for Protein: P21964

COMT, Catechol O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMTP21964 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COMTP21964 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COMTP21964 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COMTP21964 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COMTP21964 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COMTP21964 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COMTP21964 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COMTP21964 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COMTP21964 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COMTP21964 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COMTP21964 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COMTP21964 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COMTP21964 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COMTP21964 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COMTP21964 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COMTP21964 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COMTP21964 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COMTP21964 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COMTP21964 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COMTP21964 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COMTP21964 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COMTP21964 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COMTP21964 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COMTP21964 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COMTP21964 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COMTP21964 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
COMTP21964 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COMTP21964 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COMTP21964 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COMTP21964 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COMTP21964 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
COMTP21964 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COMTP21964 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COMTP21964 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
COMTP21964 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COMTP21964 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COMTP21964 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COMTP21964 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COMTP21964 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COMTP21964 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COMTP21964 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COMTP21964 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COMTP21964 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COMTP21964 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COMTP21964 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COMTP21964 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COMTP21964 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COMTP21964 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COMTP21964 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
COMTP21964 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COMTP21964 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COMTP21964 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COMTP21964 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COMTP21964 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COMTP21964 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COMTP21964 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COMTP21964 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COMTP21964 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COMTP21964 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COMTP21964 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COMTP21964 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
COMTP21964 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COMTP21964 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COMTP21964 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COMTP21964 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COMTP21964 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COMTP21964 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COMTP21964 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COMTP21964 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
COMTP21964 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COMTP21964 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COMTP21964 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COMTP21964 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COMTP21964 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COMTP21964 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
COMTP21964 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COMTP21964 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COMTP21964 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COMTP21964 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COMTP21964 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COMTP21964 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COMTP21964 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COMTP21964 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COMTP21964 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COMTP21964 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
COMTP21964 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COMTP21964 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COMTP21964 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COMTP21964 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COMTP21964 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COMTP21964 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COMTP21964 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COMTP21964 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COMTP21964 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COMTP21964 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COMTP21964 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COMTP21964 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COMTP21964 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COMTP21964 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COMTP21964 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms