Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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PTPRAP18433 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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PTPRAP18433 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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PTPRAP18433 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
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PTPRAP18433 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
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PTPRAP18433 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
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PTPRAP18433 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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PTPRAP18433 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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PTPRAP18433 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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PTPRAP18433 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRAP18433 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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