Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 TTYH3-204ENST00000407643 4537 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 HERC6-202ENST00000273960 3473 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 PNPO-217ENST00000642017 3465 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 TAX1BP1-207ENST00000433216 3174 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 PCDHGA9-201ENST00000573521 4605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 NCBP1-202ENST00000375147 5178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 EGFR-AS1-201ENST00000442411 2806 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 CAPN13-201ENST00000295055 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 ATXN2L-203ENST00000340394 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 PRDM16-208ENST00000514189 4236 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 ELN-234ENST00000621115 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 DAPK1-201ENST00000358077 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 NOA1-201ENST00000264230 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 ZNF629-201ENST00000262525 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 PPP4R3B-203ENST00000611717 5243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 TMPRSS13-205ENST00000526090 2592 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 REXO5-208ENST00000564274 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 GTF2IP13-202ENST00000609439 10247 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 PTPRN-202ENST00000409251 3622 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 SLC11A1-201ENST00000233202 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 STRN-201ENST00000263918 8168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 TRPC7-201ENST00000352189 2241 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 VWC2-201ENST00000340652 11299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 RAD1-203ENST00000382038 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 GALNT6-202ENST00000543196 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 GRIN1-205ENST00000371555 4003 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 DNMT1-201ENST00000340748 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 NXPE3-205ENST00000491511 8074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 NUMA1-234ENST00000620566 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IFITM1P13164 BDNF-202ENST00000356660 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms