Protein–RNA interactions for Protein: P11488

GNAT1, Guanine nucleotide-binding protein G(t) subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNAT1P11488 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNAT1P11488 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms