Protein–RNA interactions for Protein: O95196

CSPG5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, humanhuman

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG5O95196 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSPG5O95196 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
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