Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PPFIA3O75145 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms