Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3QRK9 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3QRK9 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3QRK9 CHGB-201ENST00000378961 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3QRK9 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3QRK9 CLGN-201ENST00000325617 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3QRK9 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3QRK9 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3QRK9 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3QRK9 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3QRK9 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3QRK9 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3QRK9 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
J3QRK9 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3QRK9 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
J3QRK9 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3QRK9 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3QRK9 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3QRK9 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
J3QRK9 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3QRK9 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3QRK9 TBX3-201ENST00000257566 4208 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3QRK9 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3QRK9 KLC4-203ENST00000394056 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3QRK9 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3QRK9 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3QRK9 MPHOSPH10-201ENST00000244230 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3QRK9 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3QRK9 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3QRK9 SLC25A35-203ENST00000579192 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3QRK9 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3QRK9 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3QRK9 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3QRK9 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3QRK9 ZNF287-201ENST00000395824 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3QRK9 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3QRK9 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3QRK9 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3QRK9 ATF6B-210ENST00000375203 2620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3QRK9 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3QRK9 MCF2L-213ENST00000421756 3560 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
J3QRK9 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3QRK9 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3QRK9 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3QRK9 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3QRK9 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3QRK9 ZNF473-203ENST00000445728 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3QRK9 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3QRK9 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3QRK9 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3QRK9 DRD2-208ENST00000542968 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3QRK9 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3QRK9 QRICH1-204ENST00000424300 3009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3QRK9 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3QRK9 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
J3QRK9 PCDHB2-201ENST00000194155 4126 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3QRK9 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3QRK9 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3QRK9 VAT1L-201ENST00000302536 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3QRK9 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3QRK9 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3QRK9 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3QRK9 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
J3QRK9 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3QRK9 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3QRK9 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3QRK9 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3QRK9 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
J3QRK9 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
J3QRK9 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3QRK9 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3QRK9 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3QRK9 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3QRK9 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3QRK9 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
J3QRK9 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3QRK9 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3QRK9 OSTM1-AS1-202ENST00000441184 3334 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3QRK9 ATP2C1-221ENST00000513801 3439 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3QRK9 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3QRK9 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3QRK9 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3QRK9 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3QRK9 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3QRK9 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3QRK9 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3QRK9 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3QRK9 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3QRK9 CHTF18-201ENST00000262315 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3QRK9 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3QRK9 ITIH5-201ENST00000397145 3132 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3QRK9 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3QRK9 PAK3-211ENST00000518291 2098 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3QRK9 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3QRK9 C1RL-201ENST00000266542 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3QRK9 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3QRK9 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
J3QRK9 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
J3QRK9 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
J3QRK9 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms