Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms