Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMG5Q9UPR3 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMG5Q9UPR3 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms