Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLKQ9UBT6 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms