Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

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Length 1,040 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 ALMS1P1-201ENST00000428767 921 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 AC010181.2-201ENST00000483759 482 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 AC122694.1-201ENST00000510987 563 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 AC106789.1-201ENST00000512927 570 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 OR4A18P-201ENST00000529103 1088 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 FAM230A-201ENST00000615181 315 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 SERPINE3-203ENST00000521255 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 BCKDHA-202ENST00000457836 1745 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 OR6S1-201ENST00000320704 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 PGM5-AS1-202ENST00000420855 572 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 CNN2P1-201ENST00000453616 918 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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PCDH10Q9P2E7 BX255923.1-201ENST00000613309 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCDH10Q9P2E7 DAP3-201ENST00000343043 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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