Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CHPF2Q9P2E5 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms