Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CCDC88CQ9P219 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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CCDC88CQ9P219 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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CCDC88CQ9P219 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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CCDC88CQ9P219 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CCDC88CQ9P219 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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