Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CENPMQ9NSP4 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms