Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FANCFQ9NPI8 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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