Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms