Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms