Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRACR2AQ9BSW2 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms