Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOXF2Q9BQY4 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms