Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 EPM2AIP1-201ENST00000322716 8126 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 DNMT3B-203ENST00000348286 4048 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 PACSIN1-207ENST00000620693 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 ATP13A2-203ENST00000452699 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 USP33-203ENST00000370793 4502 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 ZCCHC14-201ENST00000268616 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 YTHDC1-201ENST00000344157 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 FAM225A-202ENST00000453010 5625 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 SMU1-201ENST00000397149 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 FGFR1-211ENST00000425967 5375 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 XIRP1-201ENST00000340369 6460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 SEZ6-202ENST00000335960 4195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 GLI3-201ENST00000395925 8208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 KCNAB2-202ENST00000341524 4207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
SMIM7Q9BQ49 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM7Q9BQ49 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM7Q9BQ49 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM7Q9BQ49 PDE12-201ENST00000311180 8773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM7Q9BQ49 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM7Q9BQ49 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM7Q9BQ49 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM7Q9BQ49 AHI1-205ENST00000457866 5549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM7Q9BQ49 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM7Q9BQ49 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM7Q9BQ49 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM7Q9BQ49 SLC35F1-201ENST00000360388 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM7Q9BQ49 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM7Q9BQ49 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM7Q9BQ49 TMEM246-202ENST00000374848 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM7Q9BQ49 POM121L9P-201ENST00000414583 5018 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM7Q9BQ49 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM7Q9BQ49 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM7Q9BQ49 C19orf12-208ENST00000614091 4489 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM7Q9BQ49 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM7Q9BQ49 DNAJB12-201ENST00000338820 4360 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM7Q9BQ49 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM7Q9BQ49 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM7Q9BQ49 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM7Q9BQ49 RAD1-203ENST00000382038 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM7Q9BQ49 SEC31A-208ENST00000448323 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM7Q9BQ49 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM7Q9BQ49 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM7Q9BQ49 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM7Q9BQ49 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SMIM7Q9BQ49 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms