Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms