Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZA3Q96KX2 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPZA3Q96KX2 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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