Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDK5RAP3Q96JB5 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms