Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C18orf8Q96DM3 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C18orf8Q96DM3 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms