Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ3

TRIM43, Tripartite motif-containing protein 43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM43Q96BQ3 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM43Q96BQ3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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