Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD1Q8NHV4 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms