Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFT8

DNER, Delta and Notch-like epidermal growth factor-related receptor, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNERQ8NFT8 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNERQ8NFT8 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms