Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms