Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D4Q7Z3S7 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms