Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q71RC1 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q71RC1 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Q71RC1 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q71RC1 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q71RC1 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q71RC1 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q71RC1 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Q71RC1 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q71RC1 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q71RC1 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q71RC1 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q71RC1 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q71RC1 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Q71RC1 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q71RC1 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q71RC1 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q71RC1 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q71RC1 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q71RC1 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q71RC1 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q71RC1 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q71RC1 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q71RC1 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q71RC1 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q71RC1 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q71RC1 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q71RC1 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q71RC1 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q71RC1 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q71RC1 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q71RC1 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q71RC1 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q71RC1 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q71RC1 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q71RC1 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q71RC1 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q71RC1 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q71RC1 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q71RC1 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q71RC1 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q71RC1 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q71RC1 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q71RC1 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q71RC1 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q71RC1 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q71RC1 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q71RC1 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q71RC1 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q71RC1 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q71RC1 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q71RC1 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q71RC1 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q71RC1 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q71RC1 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q71RC1 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q71RC1 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q71RC1 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q71RC1 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q71RC1 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q71RC1 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q71RC1 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q71RC1 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q71RC1 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q71RC1 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q71RC1 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q71RC1 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q71RC1 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q71RC1 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q71RC1 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q71RC1 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q71RC1 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q71RC1 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q71RC1 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q71RC1 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q71RC1 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q71RC1 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q71RC1 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q71RC1 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q71RC1 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Q71RC1 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Q71RC1 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q71RC1 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q71RC1 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q71RC1 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q71RC1 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Q71RC1 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q71RC1 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q71RC1 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q71RC1 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q71RC1 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q71RC1 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q71RC1 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q71RC1 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q71RC1 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q71RC1 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q71RC1 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q71RC1 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q71RC1 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q71RC1 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms