Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

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Length 703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AGAP9Q5VTM2 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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